1. Las diferencias están en los perfiles. Hay enanos que aparecen en ambas películas (por ejemplo, Balin) y que tienen perfiles para ESDLA y para El Hobbit. Por lo tanto, cuando quieras que un héroe lidere a tropas de ESDLA, tendrá que ir con el perfil de ESDLA (y viceversa con El Hobbit); si no, tendrá que incluirse en el ejército como aliado y podrá liderar tropas de El Hobbit
Así que quedaría de tal manera que, por ejemplo, Balin el de ESDLA podría liderar guardias de Khazad, mientras que el Balin de El Hobbit podría liderar martillos siniestros.
2. Gimli sólo tiene perfil en ESDLA y, por ahora, también Dáin. En cambio, como ya te he dicho antes, Balin tiene perfiles tanto para ESDLA como para El Hobbit. Así que, según de donde escojas el perfil, podrá liderar enanos de ESDLA o de El Hobbit.
Esto mismo pasa con El Bosque Negro, existiendo un perfil para Thranduil en ESDLA y otro para El Hobbit.
3. Por ahora no han salido ni perfiles ni miniaturas que puedan disparar, salvo los héroes de la Compañía enana que puedan disponer de un arco o una honda.